הפרעות בתפקוד מערכת העיכול או functional disorders ,הם מונח המתאר הפרעה בתפקוד המעי שהיא לא מחלה. במצבים רבים קורים שינויים בתפקוד המעי, מסיבה לא ברורה, וגורמים לאי נוחות רבה וירידה באיכות החיים. מצבים אלה כוללים שינויים ביציאות (במרקם / בתדירות), רעשים בבטן, גזים מרובים, שיהוקים (גרפסים), כאבים ולחצים בבטן, תחושת תנועתיות יתר במעי, תחושת מלאות יתר לאחר ארוחה קלה, הרגשה שהמזון אינו יורד… ועוד. במצבים אלו, חשוב בשלב הראשון לבקר רופא גסטרו ולשלול מחלה. במצבים רבים, אכן נשללת מחלה אך אין שיפור במצב.
ההפרעות בתפקוד המעי יכולות להיות מסיבות רבות (שינוי בחיידקי המעי, שינוי בפירוק המזון וכד׳) ואלה נוטים להגיב מצויין לשינויים תזונתיים ספציפיים.
חשוב מאוד לנסות ולהבין את הסיבה לבעיה ולהיעזר בשינויים התזונתיים כדי להרגיע ולווסת את פעילות המעי. מנסיוני, ברוב הגדול של המקרים יש הקלה רבה עד היעלמות התסמינים בזמן קצר יחסית.